位於五丈殿北側，與御酒殿神並立。社名中的「由貴」意為潔淨無穢，此處原是存放獻神供品的倉庫。因改建而卸下任務的舊社殿，後來移交給因火災失去本殿的京都與杼神社，自1975年起充當其臨時本殿達四年之久。